1. Prologue「在生命进化的最尽头」
2. Phase.l「S.I.R.E.N」
3. Phase.2「邂逅的少女」
4. Phase.3「福音机关依斯加略」
5. Phase.4「天命」
6. Phase.5「神性幻想种菲欧拉米莉丝」
7. Epilogue「愿你与心爱的人相遇——」
8. 后记
9. 插图
10. Prologue「报告:暴君」
11. Phase.l「天使相伴的日常 」
12. Phase.2「禁忌之兽」
13. Phase.3「不速之客」
14. Phase.4「天使与理装执行者」
15. Phase.5「不完全意附体『暴君』」
16. Intermission「超越者们」
17. Epilogue「其心——」
18. 后记
19. 插图
20. Phase.0「龙人诞生 —纪录—」
21. Phase.l 「Ω指定种 —预兆—」
22. Intermission.1
23. Phase.2 「红色标记 —威胁—」
24. Intermission.2
25. Phase.3「最强生物 —邂逅—」
26. Intermission.3
27. Phase.4「被创造物 —交错—」
28. Intermission.4
29. Phase.5 「奇里榭 —人类—」
30. Epilogue「龙之少女到达的地方」
31. 后记
32. 插图
33. Prologue「红与蓝」
34. Phase.l 「蓝之第三相」
35. Intermission.l
36. Phase.2「红之大特异点」
37. Phase.3「观察者」
38. Phase.4「兄妹」
39. Intermission.2
40. Phase.5「烧尽一切的红莲，其尽头——」
41. Epilogue「预定的命运」
42. 后记
43. 插图
44. S.I.R.E.N.短篇
45. Prologue「凝冻的两人」
46. Phase.1「现象的中心——中央统合树——」
47. Phase.2「彼此冲突的意志」
48. Phase.3「世界颤抖之日」
49. Phase.4「结着蓝色之果的大树」
50. Phase.5「伤痕、真天使、然后——」
51. Epilogue「在这世界的某个角落」
52. 后记
53. 插图